Afin de répondre au Règlement européen CE n°1100/2007, la France a élaboré son Plan de Gestion Anguille (PGA), validé en 2010 par la Commission européenne.
Le PGA Français prévoit d’agir à court et moyen terme sur les principaux facteurs anthropique de mortalité et de dérangement de l’anguille :
– Réduire et encadrer l’activité de pêche professionnelle (quota de pêche, contingentement des licences, contrôle des captures)
– Interdire toute pêche récréative de civelles et limiter la pêche d’anguille jaune.
– Assurer la préservation et la reconquête des habitats : protection des habitats, franchissabilité des ouvrages (barrages, turbines)  
– Réduire la mortalité par pompage
– Réduire la mortalité par pollution chimique
– Réduire le braconnage en verrouillant la filière commerciale
Afin de tenir compte des spécificités locales, sa mise en application est déclinée à l’échelle des grands bassins versants, aussi appelés Unité de gestion anguille (UGA).

En parallèle, le PGA Français prévoit que 5 à 10 % du quota repeuplement national soit réservé aux projets de repeuplement de son territoire, le restant étant destiné aux opérations de repeuplement européen.